仓单质押担保模式中，银行基于风险的考虑不直接给予借款企业以质押物担保贷款，而是要求通过有实力的仓储企业信用担保来贷款，仓储企业则以借款企业的质押物进行反担保，这是反向担保融资，是存货质押业务的衍生。反担保形式也可以有其他多种方式，比如以借款企业自身资产、借款企业的控股股东担保、其他企业联合担保等。这样银行借助有良好信用的仓储企业能大大降低贷款风险，同时降低了仓储企业与街狂企业合谋的可能。而仓储企业因以自身信用担保来帮助借款企业进行贷款而更加深入地参与到其中，可以说是仓储企业通过自身的资本实力更深层次地参与到了生产型企业的银行融资行为中，实质上也是其很好地利用自身可以较好控制货物物流的能力，进一步拓展业务范围，提高市场竞争力和盈利能力。
对于某些以寄存在仓储企业仓库中的货物向银行申请仓单融资仍有困难的中小企业，可以通过反担保模式得到贷款。该模式需要大型仓储企业构建中小企业信用担保体系，仓储企业以中小企业寄存的货物作为反担保抵押物，通过担保实现贷款；或者仓储企业直接为中小企业申请仓单质押贷款提供担保，间接地提供中小企业信用。具体操作流程如图7-3所示。
仓储企业在仓单质押担保模式中起着至关重要的作用，质物在仓储期间非自然的损失由企业来承担，同时仓储企业需印证借款企业提货单的真伪，如因借款企业伪造经银行确认的提货单仓储企业给予发货而给银行带来的损失需仓储企业承担。另外在动态质押中，仓储企业需对新质物进行估值，避免借款企业以次充好而产生坏货风险。货权风险也要给予关注，特别是在对借款企业自有仓库的监管上，如何判断借款企业对入库的质物是否有所有权或处置权十分重要，当然也存在一定的难度。要避免多重质押和非法的质押物，在委托监管对象上尽量选择与自身有长期业务往来的企业并选择适当的质押物品种。由于银行自身对质物的市场等了解不足，选择与专业实力强的仓储企业进行合作尤为重要，这样可以帮助银行对质物有效监管，并且减少仓储企业与借款企业合谋骗取银行贷款的可能性。在需要对质物拍卖变现时，仓储企业也能帮助银行尽量减少损失。
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